Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frmpd1A2AKB4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms