Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ambra1A2AH22 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ambra1A2AH22 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms