Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ccdc194A0A140LIT1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc194A0A140LIT1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc194A0A140LIT1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccdc194A0A140LIT1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc194A0A140LIT1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc194A0A140LIT1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc194A0A140LIT1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc194A0A140LIT1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc194A0A140LIT1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc194A0A140LIT1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccdc194A0A140LIT1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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