Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VarsQ9Z1Q9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VarsQ9Z1Q9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms