Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cry2Q9R194 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cry2Q9R194 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms