Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms