Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hmgn5Q9JL35 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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