Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Erg28Q9ERY9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms