Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SgshQ9EQ08 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SgshQ9EQ08 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms