Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SelenooQ9DBC0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenooQ9DBC0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenooQ9DBC0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenooQ9DBC0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SelenooQ9DBC0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms