Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Srp19Q9D7A6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Srp19Q9D7A6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Srp19Q9D7A6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Srp19Q9D7A6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Srp19Q9D7A6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms