Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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