Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Sgo1Q9CXH7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Sgo1Q9CXH7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Sgo1Q9CXH7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Sgo1Q9CXH7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Sgo1Q9CXH7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Sgo1Q9CXH7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Sgo1Q9CXH7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Sgo1Q9CXH7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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