Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Sec61bQ9CQS8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Sec61bQ9CQS8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms