Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab5aQ9CQD1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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