Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms