Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bp5lQ99LH9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Sh3bp5lQ99LH9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Sh3bp5lQ99LH9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bp5lQ99LH9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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