Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ciao1Q99KN2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ciao1Q99KN2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms