Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ctu1Q99J10 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ctu1Q99J10 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ctu1Q99J10 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ctu1Q99J10 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctu1Q99J10 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ctu1Q99J10 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ctu1Q99J10 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ctu1Q99J10 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ctu1Q99J10 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ctu1Q99J10 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ctu1Q99J10 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ctu1Q99J10 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctu1Q99J10 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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