Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clip1Q922J3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms