Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smc1bQ920F6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smc1bQ920F6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smc1bQ920F6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smc1bQ920F6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smc1bQ920F6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Smc1bQ920F6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Smc1bQ920F6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Smc1bQ920F6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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