Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LgsnQ8CIX8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LgsnQ8CIX8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms