Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbm28Q8CGC6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms