Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc73Q8CDM4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc73Q8CDM4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc73Q8CDM4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc73Q8CDM4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc73Q8CDM4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms