Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc3Q8CCH2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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