Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod1Q8BVA4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms