Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cxcl16Q8BSU2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms