Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Smim19Q80ZU4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Smim19Q80ZU4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Smim19Q80ZU4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Smim19Q80ZU4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Smim19Q80ZU4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Smim19Q80ZU4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Smim19Q80ZU4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Smim19Q80ZU4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim19Q80ZU4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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