Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcsk9Q80W65 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms