Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims3Q80U57 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims3Q80U57 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms