Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms