Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lrrc8eQ66JT1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Lrrc8eQ66JT1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lrrc8eQ66JT1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lrrc8eQ66JT1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lrrc8eQ66JT1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lrrc8eQ66JT1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lrrc8eQ66JT1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lrrc8eQ66JT1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lrrc8eQ66JT1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lrrc8eQ66JT1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Lrrc8eQ66JT1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lrrc8eQ66JT1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms