Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnna3Q65CL1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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