Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Zfp248Q640N4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Zfp248Q640N4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Zfp248Q640N4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Zfp248Q640N4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Zfp248Q640N4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Zfp248Q640N4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Zfp248Q640N4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Zfp248Q640N4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Zfp248Q640N4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Zfp248Q640N4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Zfp248Q640N4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Zfp248Q640N4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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