Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Scn9aQ62205 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Scn9aQ62205 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Scn9aQ62205 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scn9aQ62205 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scn9aQ62205 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn9aQ62205 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scn9aQ62205 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scn9aQ62205 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms