Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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PcolceQ61398 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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PcolceQ61398 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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PcolceQ61398 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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PcolceQ61398 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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