Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Traf3Q60803 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Traf3Q60803 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Traf3Q60803 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Traf3Q60803 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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