Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD8

Nxf2, Nuclear RNA export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf2Q4ZGD8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nxf2Q4ZGD8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms