Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms