Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zmat1Q3V0C1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Zmat1Q3V0C1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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