Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx27Q3UHD6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms