Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rnf180Q3U827 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rnf180Q3U827 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf180Q3U827 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf180Q3U827 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf180Q3U827 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf180Q3U827 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf180Q3U827 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf180Q3U827 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Rnf180Q3U827 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf180Q3U827 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf180Q3U827 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf180Q3U827 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf180Q3U827 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf180Q3U827 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rnf180Q3U827 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rnf180Q3U827 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rnf180Q3U827 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf180Q3U827 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf180Q3U827 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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