Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec24aQ3U2P1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms