Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Srsf6Q3TWW8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms