Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hddc2Q3SXD3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hddc2Q3SXD3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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