Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms