Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sec23aQ01405 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sec23aQ01405 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms