Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms