Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PgrQ00175 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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PgrQ00175 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PgrQ00175 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms