Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irx1P81068 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irx1P81068 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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